明仁多年來醉心研究動物，尤其是鰕虎魚。

明仁在位最後一篇論文，是關於葦登（圖）的研究。
（神秘的地球uux.cn報道）85歲高齡的日皇明仁其實是位國際知名的魚類學者，迄今共發表了33篇有關鰕虎魚的論文，由於他將於周二（30日）讓位予皇太子德仁，是以在本月初發表的一篇，相信是他在位期間發表的最後一篇論文。
該論文4月5日在日本魚類學會的電子期刊公開，是明仁聯同6名研究人員執筆。他們研究在京都仙洞禦所的池塘內生活的吻鰕虎屬魚類“葦登”，分析其DNA後得出結論，指出葦登是由棲息於滋賀縣琵琶湖的鰕虎魚Rhinogobius biwaensis，和棲息於京都盆地池塘等地的鰕虎魚Rhinogobius tyoni所雜交而成的品種。
明仁的論文有9篇是在登基後發表，其論文一向以縝密著稱，獲國內外高度評價；他對鰕虎魚的研究尤其廣為人知，更是其首篇論文的內容。為表揚明仁身為科學研究者的功績，英國皇家學會曾在1998年頒授“查理斯二世獎章”給他，更有鰕虎魚新品種被命名為“明仁鰕虎魚屬”。
明仁自幼已對各種生物展現非凡興趣，即位前已是日本魚類學會會員。皇居內更設有專屬生物實驗室、研究助理，及為研究而飼養動物。他重視實證研究，曾說出“直到我親眼看到標本和實驗數據，我才會信服”、“絕不想熄滅研究之火”等金句。
京都大學名譽教授中坊徹次，已作為明仁的研究夥伴近40年。他讚揚明仁兼備作為研究者必備的不妥協、好奇心以及耐心，又指公務繁忙的明仁，總能適當分配時間做研究，希望他退位後仍可沉醉於研究。